Ghost Stories narra o conto de Satsuki Miyanoshita, que se muda com sua família para a cidade natal de sua falecida mãe. Em seu primeiro dia de escola, Satsuki, seu irmão Keiichirou, um estudante do primeiro; seu vizinho Hajime Aoyama; Koigakubo Momoko, uma antiga colega de escola, e Kakinoki Leo, um colega e amigo do Hajime com uma propensão para o paranormal visitar a escola abandonada construção adjacente ao complexo escolar atual e descobrir que o prédio é mal-assombrada. 
É logo depois de revelado que a mãe de Satsuki era responsável pela selagem vários fantasmas que assombravam não só a escola, mas também a cidade, e agora eles são liberados devido à urbanização em curso na área circundante.Satsuki mãe deixou para trás um livro que detalha a forma de exorcizar os fantasmas de uma vez por todas. Em seu primeiro confronto, Satsuki enfrenta um demônio chamado Amanojaku, mas no processo Amanojaku está selado dentro de gato de estimação de Satsuki, Kaya. Embora Amanojaku não quer ajudar Satsuki em primeiro lugar, o perigo logo ameaça envolver a cidade e é deixada para Satsuki, seus amigos e Amanojaku para deter os fantasmas.